主人公天野雪辉是一个闭塞的少年，在生活中总是作为一个旁观者的他爱好将自己所有的见闻以日记的形式记录在手机中。雪辉所谓的朋友都是自己幻想出的形态。某日，雪辉自身假想出来的时空之王Deus给予了他预见自身未来的能力。即将发生的事情都提前显示在手机上——这便所谓的“未来日记”。
雪辉的生活因此发生了突变，Deus告戒自己：日记即雪辉自身，日记(手机)一旦被毁,持有者的未来也就消失了。某日在学校中，雪辉赫然发现手机中显示了“被歹徒追杀，我被杀死，DEAD END”的字样，恐慌中雪辉的同学我妻由乃出现在他面前，告知其本人也是“未来日记”的持有者之一，并且在她的未来日记中显示的是雪辉的未来。没想到的是，追杀者同样是未来日记的持有者。在由乃的刺激下，雪辉用飞标破坏了杀手的手机，追杀者的生命也随即消失。
Deus告知雪辉，所有的一切都是一场生存游戏，最后生还的日记持有者将作为自己后继……
